L'assemblée générale se réunit au moins une fois par an pour délibérer sur la planification et le bilan. Tous les trois ans, les membres élisent un président, un directeur et un représentant légal, les autres membres du conseil d'administration et les commissaires aux comptes.
Le bureau exécutif supervise le travail des structures opérationnelles, nomme les responsables concernés et prend diverses décisions d'importance générale.
La coordination opérationnelle des activités est assurée par le bureau exécutif, qui est composé du président, du directeur et d'autres gestionnaires nommés par le conseil d'administration.
Les projets sont coordonnés au siège de Rome par les directeurs des zones géographiques: Laura Carraro, Afrique; Luigi Grando, Amérique latine et Caraïbes; Deborah Rezzoagli, Europe orientale et Asie; Gianluca Falcitelli, Moyen-Orient et Méditerranée; Giordana Francia, Italie et Union européenne.
Pour garantir un niveau élevé de qualité opérationnelle et de coordination interinstitutionnelle, le CISP a établi des bureaux locaux gérés par les représentants nationaux dans les pays où nous opérons le plus intensivement.
Le CISP dispose également de bureaux régionaux en Italie pour consolider les relations avec le pays et les institutions locales.